Aquineuro a développé une gamme de logiciels permettant l’analyse des données de comportement, de photométrie et d’électrophysiologie. Ces solutions logicielles, issues de notre expertise en neurosciences peuvent être utilisées sous licences telles quelles ou adaptées à vos besoins spécifiques ou aux expérimentations complexes.
Trois solutions sont détaillées ici – Video Tracking, OE Converter et Ephys Viewer :
Video Tracking
L’ analyse du comportement animal est un élément central dans la compréhension des mécanismes neuronaux responsables de la cognition humaine.
Cette analyse comportementale qui fut d’abord purement descriptive et basée sur la prise de note manuscrite s’est énormément développée ces dernières années grâce à la numérisation des données (démocratisation des enregistrements vidéos) ainsi que l’utilisation d’outils informatiques pour l’analyse des images récoltées.
C’est dans ce cadre que nous avons développé un programme d’analyse vidéos (video tracking) permettant d’extraire la position, la vitesse et le degré d’immobilité de l’animal au cours de l’expérience.
OE Converter
Les données électrophysiologiques brutes (directement issues du système d’enregistrement), ne sont pas toujours immédiatement exploitables.
Les fichiers peuvent être trop volumineux ou leur format ne convient pas toujours à la chaîne d’analyse utilisée habituellement dans le laboratoire. Pour palier à ces contraintes nous avons développé un logiciel pour convertir le format de ces données “brutes”.
Ephys Viewer
Les données électrophysiologiques brutes sont ensuite filtrées pour extraire les évènements le s plus rapides (potentiels d’actions) à l’aide de logiciels classiques de ‘spike sorting’ (MCLust, offline sorter, kilosort 2 ou tridesclous). Une fois extrait c’est évènements rapides peuvent être observés à l’aide de notre logiciel.
Deux types d’analyses sont proposées pour le moment: une analyse temporelle ISI, autcorrelograms, crosscorelograms ainsi que des danalyse de corrélation avec les événements comportementaux de type raster et Peri Stimulus Time Histograms (PSTHs).
